隨著環境監測工作任務越來越重，環境監測人員變得極為稀缺，工作做不完，目標達不到，加上行政管理部門借調人員，使得監測單位的實際人數見當初單位成立時還少。

環境監測監測任務呈數量級的增加。據統計，一是環境質量監測工作量增加近倍。如地表水的監測項目由年的項增加到現在的項，監測因子增加倍多，監測頻次由原來的兩月次增加到現在的每月次，河流責任目標考核斷面水質監測從無到有并逐步增加，手工頻次從每月次增加到現在的每周取樣與自動監測儀器比對次，如有異常還要增加頻次。環境空氣、降水（酸雨）、噪聲的監測點位、監測因子和監測頻次也成倍增加。二是污染源和環境管理監督性監測工作量增加十多倍。因此，當前環境監測發展的主要障礙就是監測人員的嚴重不足。目前，監測機構都是政府部門的下屬單位，基本都屬于事業單位編制，監測機構沒有人事主動權。在現在就業形勢很是困難的情況下，行政管理部門到處打招呼安排親信人員，監測機構只能被動接收這些的人員，加上一些國家政策性人員的安置，導致監測機構需要的人才進不來，不需要的人員硬往里塞。部分監測機構現行的人員情況是在編制的人員不干活，不在編的人員充當頂梁柱。

針對以上種種形式，監測部門引進自己需要的高、精、尖技術人才是難上加難。另一方面，監測部門在用人方面沒有競爭激勵機制，因而才會面臨諸多問題。