在傳統的運行管理模式中，環境監測系統的日常運行進行維護、運行質量控制工作等通常均由監測站的工作人員實施。該種管理模式中在實際應用過程中存在的缺陷主要表現在以下幾個方面：

1.從管理工作性質角度進行分析，環境監測工作要求工作人員具備較廣的知識和技術，專業技術要求較高，主要涵蓋電器電路、網絡技術、自動化控制等，因此，只有專業知識和技術扎實的工作人員才能完成好相應的環境監測工作。

2.從行政職能角度分析，環境監測系統運行管理人員在數量上也相對較少，因此工作人員的工作內容較為繁重，工作量大。這種現象的存在導致工作人員無法對相關問題進行深入地研究；再次，目前，市場上的環境監測儀器品牌呈現出多樣化，缺乏統一性，進而導致環境監測系統的運行管理與質量控制二者無法同時實施，大大增加了工作人員的工作難度；最后，環境監測儀器設備改進、更新速度快，工作人員的專業知識和技能未能得到及時充實和更新，進而限制管理、控制水平的提高。

如上所述，環境監測系統傳統運行管理模式存在很多弊端，對于系統管理模式的改進和創新是當下系統行業發展的一大方向。